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生命科学学院2020级凤凰班本科生在国际期刊Nucleic Acids Research发表高水平文章

2023-11-03

2023年10月,河北大学生命科学学院2020级生命科学凤凰班本科生程美琪,以共同第一作者身份在《Nucleic Acids Research》(最新影响因子为14.9)发表论文“BATMAN-TCM 2.0: an enhanced integrative database for known and predicted linkages between traditional Chinese medicine ingredients and target proteins”,成为继2018级孔祥任、2019级瞿英杰之后,第三位在国际期刊发表高水平论文的生命科学凤凰班本科生,凤凰班本科生梅志君、李向东、刘鹏为该论文的共同作者。该项工作由河北大学生命科学学院同国家蛋白质科学中心(北京)联合开展,生命科学学院是第三署名单位。这是生命科学学院与国家蛋白质科学中心科教结合、协同育人的又一重要成果。

BATMAN-TCM是国家蛋白质科学中心研发的一个用于研究中药成分与靶标蛋白之间相互作用的分析体系(http://bionet.ncpsb.org.cn/batman-tcm/),BATMAN-TCM 1.0在发表后受到了学术界的广泛关注,目前已有超过640次论文引用和40万次访问。BATMAN-TCM 2.0新增了通过组学数据筛选潜在中药的功能,并对数据库中已知和预测的中药成分与靶标蛋白之间的相互作用数据进行扩增。BATMAN-TCM 2.0数据库对中药药物研发以及寻找治疗复杂疾病的潜在药物都具有十分重要的意义。

生命科学学院高度重视生物学拔尖创新人才的培养,于2015年与国家蛋白质科学中心(“凤凰中心”)签订了《联合共建“生命科学凤凰班”战略合作协议》,共同培养高水平的生物信息学人才。凤凰中心作为我国生命科学领域的首个国家重大科学基础设施,部署了国际上最大规模的高端蛋白质组测序平台以及以“天河2号”架构超级计算机为代表的顶尖设备,为我校本科生培养提供了得天独厚的学习条件。多年来,生命科学凤凰班已毕业5届89名本科生,在SCI期刊发表12篇研究论文。

随着科教结合协同育人的深入开展,河北大学生命科学学院与凤凰中心会更加紧密合作,探索育人新模式,携手并进,共创辉煌!

附:凤凰班三位同学的基本情况

程美琪,河北大学2020级凤凰班本科生,已免试推荐军事科学院2024级生物信息专业硕士研究生。2023年10月(大四上学期)以并列第一作者在《Nucleic Acids Research》(当年影响因子14.9)发表论文“BATMAN-TCM 2.0: an enhanced integrative database for known and predicted linkages between traditional Chinese medicine ingredients and target proteins”。

瞿英杰,2019级凤凰班本科生,现为军事科学院2023级生物信息专业在读五年制直博研究生。2022年8月(大三下学期)以并列第一作者在《Cells》(当年影响因子7.6)发表论文“Integration of Human Protein Sequence and Protein-Protein Interaction Data by Graph Autoencoder to Identify Novel Protein-Abnormal Phenotype Association”,并被所发表期刊评为当期最佳论文(“Editor’s Choice”)。

孔祥任,2018级凤凰班本科生,现为军事科学院生物信息专业2022级在读硕士研究生。2021年10月(大四上学期)以并列第一作者在《Nucleic Acids Research》(当年影响因子19.1)发表论文“UbiBrowser 2.0: a comprehensive resource for proteome-wide known and predicted ubiquitin ligase/deubiquitinase–substrate interactions in eukaryotic species”。

(生命科学学院 供稿)